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张博士,你是不是研究了个寂寞?
【 文化专题 】 2021-08-25 15:08:00
说说张文宏的这个博士论文究竟研究了啥
08-24 21:52
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事情是这样的。异烟肼是一种治疗结核病的常用抗生素。结核病的致病菌结核分枝杆菌有一个KatG基因,它是编码过氧化氢酶-过氧化物酶的。在这种酶的作用下,异烟肼能抑制结核分枝杆菌细胞壁的合成,这样就抑制了这种致病菌。
人们发现,结核分枝杆菌的针对异烟肼的耐药性是和KatG基因有关系的,这个KatG基因编码产生的化氢酶-过氧化物酶活性越弱,异烟肼对结核分枝杆菌的药效就越差(这个很容易理解,因为异烟肼抗菌需要过氧化氢-过氧化物酶作用一下,如果这个酶活性不太好,异烟肼就不太容易发挥功效)。
那么,这个问题就转化成了,KatG基因的哪些突变会导致它编码的过氧化氢酶-过氧化物酶的活性减弱,换句话说,有哪些突变的KatG基因意味着结核分枝杆菌更耐异烟肼?
1996年的时候,美国FDA的David Rouse等人,人工修改了结核分枝杆菌的KatG基因,研究一下常见的一些突变之中的哪些会导致氧化氢酶-过氧化物酶活性降低,哪些突变不会导致降低。Rouse等人一共研究了14种突变(R104L、H108Q、N138S、S140N、L148R、H270Q、T275P、S315T、W321G、A350T、D381G、R463L、R463G和L587M,数字代表密码子位置,右边的字母是被取代的氨基酸的单字母缩写,左边字母是取而代之的氨基酸的单字母缩写),结果发现上述一些突变没改变氧化氢酶-过氧化物酶活性,而另一些降低了活性。
好了,现在该说张文宏的这个博士论文了。张文宏其实是知道Rouse等人的这个研究的。他的论文第34页说“但在近年,国外有多篇文献对R46 L突变点的异议,此后美国的Rouse等人也证实在相当部分的敏感菌株中发现有R46 3L的变异[6,7]“
而那个[6],看脚注就是Rouse DA,Devito JA,Li Z,et al.Site-directed mutagenesis of the katG gene of mycobacterium tuberculosis:effects on Catalase-peroxidase activities and isoniazid resistance.Mol Microbiol.1996.22:583,也就是我上面说的1996年Rouse等人的这个研究。
换句话说,既然张文宏引用了这篇,他一定是知道Rouse等人一共研究了那14种突变,且后者发现了R463L突变没降低氧化氢酶-过氧化物酶活性、S315T让活性降低了50%。
但是他在论文里似乎装不知道,他虽然是引用了Rouse的这篇论文,但是提及这篇论文的时候却只说“但在近年,国外有多篇文献对R463L突变点的异议,此后美国的Rouse等人也证实在相当部分的敏感菌株中发现有R463L的变异[6,7]“
那个[6]不是”证实在相当部分的敏感菌株中发现有R463L的变异“,而是用实验证明了R463L变异没改变过氧化氢-过氧化物酶的活性啊。
那么,张文宏研究了什么呢?他就是用和Rouse等人用同样的方法,去研究了一下Rouse等人研究的那14种突变中的R463L和S315T,然后得出结论,R463L突变没降低酶活性,S315T降低了活性一半。
换句话说,他就是重复了一下Rouse等人的实验,而且只重复了其中的1/7,而且,他还不直接告诉你,他当然知道Rouse的这项研究,以及他做出来的这些结论,Rouse等人在1996年就做出来了。
这也就是张文宏在论文第34页里引用了Rouse等人的研究但是做引而不发跃如也状的原因。
如果他直接说,“啊,其实Rouse他们几年前已经发现了R463L突变没降低酶活性、S315T降低了活性一半“。
那么别人要么是会问:你怀疑Rouse造假所以去重复人家的实验吗?但是你要是质疑Rouse造假,至少要提到Rouse研究了那14种突变对酶活性的影响啊。
要么会问:你这是研究了个寂寞吗?
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